宠物小精灵第一季主要内容：怀着远大梦想，立志成为世界第一的神奇宝贝训练师，来自真新镇的少年小智，正进行着修行之旅。
他和最先从大木博士那里得到的神奇宝贝皮卡丘，还有中途结识的少女小霞，以及目标是成为饲养员的小刚一行人浩浩荡荡地继续旅行。
为了获得神奇宝贝联盟大赛的参赛资格，小智四处挑战各地的训练馆馆主。另外，每当遇见需要帮助的神奇宝贝或训练师时，他都无法置之不理。到目前为止，他不但唤醒了堵住河川呼呼大睡的卡比兽，也让非常弱小，完全无法在对战中获胜的派拉斯，进化成了派拉斯特。十分地活跃喔，
虽然小智的修行之旅看起来非常顺利，但实际上，他碰到了难题——那就是小火龙进化成火恐龙之后，就完全不听小智的话了，这是不是代表他的修行还不够呢？为了今后不再被火恐龙轻视，加油啊！小智！
第一季（包括石英联盟，橘子联盟，城都联盟）：杰尼龟，小火龙（进化成喷火龙），妙蛙种子，绿毛虫（进化成巴大蝴，之后离队），比比鸟（进化成比雕，之后离队），大钳蟹（进化成巨钳蝎），火爆猴（之后离队），臭臭泥，肯泰罗，小智妈妈的吸盘魔偶，乘龙（之后离队），卡比兽，赫拉克罗斯，菊草叶（进化成月桂叶），小锯鳄，猫头夜鹰，小小象（进化成顿甲）